Die Entdeckung von Bruchstücken attischer Vasen aus dem 5. Jahrhundert vor Christus und zahlreicher anderer Gegenstände in der Nähe von Santa Marina di Focara zeugt von der antiken Existenz eines kleinen Hafens an der Küste des San Bartolo, in dem in der Antike Schiffe aus Griechenland anlegten, um anschließend die Häfen Adria und Spina weiter nördlich anzulaufen. Der Hafen, der zunächst den allgemeinen Namen „di Focara“ annahm, wurde im römischen Zeitalter in die Bucht Vallugola versetzt und blieb über das gesamte Mittelalter bis zur modernen Zeit ein aktiver Umschlagplatz für Waren. Nach Analysen der archäologischen Fundstücke geht man davon aus, dass die Molen des Hafens auf Pfahlbauten ruhten und große Lager für die Waren zur Verfügung standen. Nach der Völkerwanderung und der Befreiung des Landes durch die Byzantiner erfuhr der Handel über diesen Hafen eine neue Blüte, wie der Umschlag aller aus Dalmatien importierten Waren belegt.
Nach der lokalen Ortnamenkunde könnte der Name Vallugola von Valle lucula (dunkles Tal aufgrund des Waldes) oder Valle dell’ugola in Bezug auf das bekannte Phänomen des Echos, das man hier hören kann, abgeleitet sein. Als nahe liegend wird jedoch auch der Ursprung Vallisi uvula, die Verkleinerungsform von Traube, angenommen, womit ein <Tal der kleinen Weine> umschrieben wird. Tatsächlich gehörte der Wein, zusammen mit Mehl, Getreide, Ackerbohnen und Feigen, zu den am meisten umgeschlagenen Produkten.
Der Hafen stellte auch eine wichtige Ergänzung des Hafens Pesaro dar, der aufgrund der Lage an der Mündung des Flusses Foglia oft überschwemmt und versandet wurde; für die Gemeinden der nahe gelegenen Hügel war Vallugola zudem viel leichter zu erreichen und demnach ideal, um die eigenen Waren zu verladen, befand man sich doch in unmittelbarer Nähe der nach einem römischen Konsul benannten Straße Flaminia. Auch für die Schiffe bot er eine wichtige Notanlegestelle, und zwar dank der antiken Quelle Mida, die man zur Trinkwasserversorgung leicht erreichen konnte.
Der hohe Stellenwert des Hafens Vallugola endete erst im Jahr 1614, als Francesco Maria II Della Rovere entschied, den Verlauf des Flusses Foglia in Pesaro zu ändern, um einen modernen Hafen einzurichten, in dem die in jener Zeit neu gebauten Schiffe mit höherer Ladekapazität und größerem Tiefgang einlaufen konnten.